Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms