Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN3P54252 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms