Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLNS1AP54105 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms