Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP98P52948 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP98P52948 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP98P52948 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP98P52948 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP98P52948 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP98P52948 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP98P52948 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP98P52948 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP98P52948 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP98P52948 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP98P52948 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP98P52948 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP98P52948 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP98P52948 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP98P52948 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP98P52948 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP98P52948 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP98P52948 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP98P52948 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP98P52948 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP98P52948 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP98P52948 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP98P52948 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP98P52948 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP98P52948 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP98P52948 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUP98P52948 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP98P52948 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP98P52948 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP98P52948 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP98P52948 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP98P52948 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP98P52948 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP98P52948 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP98P52948 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP98P52948 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP98P52948 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP98P52948 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP98P52948 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP98P52948 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP98P52948 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP98P52948 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP98P52948 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP98P52948 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP98P52948 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP98P52948 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP98P52948 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP98P52948 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP98P52948 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP98P52948 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP98P52948 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP98P52948 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP98P52948 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP98P52948 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP98P52948 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP98P52948 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP98P52948 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP98P52948 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP98P52948 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP98P52948 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP98P52948 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP98P52948 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP98P52948 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP98P52948 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP98P52948 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP98P52948 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP98P52948 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP98P52948 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP98P52948 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP98P52948 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP98P52948 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP98P52948 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms