Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF140P52738 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms