Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA1P52294 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA1P52294 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA1P52294 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA1P52294 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA1P52294 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA1P52294 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA1P52294 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA1P52294 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms