Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK4P51957 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK4P51957 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK4P51957 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK4P51957 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK4P51957 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK4P51957 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK4P51957 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK4P51957 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK4P51957 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK4P51957 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEK4P51957 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK4P51957 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK4P51957 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK4P51957 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK4P51957 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK4P51957 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK4P51957 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK4P51957 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK4P51957 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK4P51957 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK4P51957 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK4P51957 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK4P51957 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK4P51957 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK4P51957 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK4P51957 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK4P51957 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK4P51957 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK4P51957 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK4P51957 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK4P51957 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK4P51957 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK4P51957 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK4P51957 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK4P51957 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK4P51957 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK4P51957 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK4P51957 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK4P51957 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK4P51957 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK4P51957 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK4P51957 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK4P51957 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK4P51957 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK4P51957 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK4P51957 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK4P51957 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK4P51957 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK4P51957 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK4P51957 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK4P51957 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK4P51957 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEK4P51957 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NEK4P51957 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEK4P51957 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NEK4P51957 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEK4P51957 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NEK4P51957 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEK4P51957 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEK4P51957 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEK4P51957 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEK4P51957 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEK4P51957 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK4P51957 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK4P51957 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK4P51957 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK4P51957 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK4P51957 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK4P51957 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK4P51957 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK4P51957 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK4P51957 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK4P51957 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK4P51957 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK4P51957 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK4P51957 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK4P51957 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK4P51957 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK4P51957 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK4P51957 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK4P51957 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK4P51957 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK4P51957 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK4P51957 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK4P51957 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK4P51957 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK4P51957 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK4P51957 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK4P51957 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK4P51957 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK4P51957 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK4P51957 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK4P51957 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK4P51957 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK4P51957 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK4P51957 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK4P51957 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms