Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK2P51955 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK2P51955 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK2P51955 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK2P51955 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK2P51955 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK2P51955 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK2P51955 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK2P51955 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK2P51955 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK2P51955 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK2P51955 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK2P51955 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK2P51955 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK2P51955 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK2P51955 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK2P51955 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK2P51955 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK2P51955 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK2P51955 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK2P51955 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK2P51955 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK2P51955 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK2P51955 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK2P51955 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK2P51955 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK2P51955 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK2P51955 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK2P51955 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK2P51955 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK2P51955 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK2P51955 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK2P51955 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK2P51955 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK2P51955 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK2P51955 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK2P51955 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK2P51955 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK2P51955 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK2P51955 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK2P51955 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK2P51955 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK2P51955 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK2P51955 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK2P51955 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK2P51955 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK2P51955 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK2P51955 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK2P51955 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK2P51955 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK2P51955 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK2P51955 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK2P51955 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK2P51955 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK2P51955 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK2P51955 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEK2P51955 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK2P51955 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK2P51955 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK2P51955 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK2P51955 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK2P51955 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK2P51955 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK2P51955 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK2P51955 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms