Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAMP7P51809 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms