Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8P50990 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8P50990 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8P50990 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8P50990 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8P50990 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8P50990 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8P50990 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT8P50990 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT8P50990 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT8P50990 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT8P50990 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8P50990 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8P50990 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8P50990 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8P50990 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8P50990 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8P50990 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8P50990 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8P50990 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8P50990 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8P50990 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8P50990 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8P50990 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8P50990 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8P50990 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8P50990 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8P50990 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8P50990 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8P50990 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8P50990 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8P50990 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8P50990 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8P50990 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8P50990 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8P50990 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms