Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBP50607 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBP50607 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBP50607 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBP50607 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBP50607 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBP50607 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBP50607 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBP50607 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBP50607 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBP50607 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBP50607 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBP50607 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBP50607 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBP50607 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBP50607 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBP50607 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBP50607 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBP50607 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBP50607 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBP50607 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBP50607 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBP50607 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBP50607 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBP50607 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBP50607 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBP50607 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBP50607 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBP50607 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBP50607 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBP50607 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBP50607 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBP50607 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBP50607 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBP50607 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBP50607 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBP50607 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBP50607 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBP50607 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBP50607 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBP50607 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBP50607 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBP50607 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBP50607 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBP50607 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBP50607 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBP50607 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBP50607 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBP50607 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBP50607 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBP50607 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBP50607 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBP50607 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBP50607 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBP50607 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBP50607 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBP50607 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBP50607 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBP50607 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBP50607 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBP50607 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBP50607 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBP50607 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBP50607 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBP50607 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBP50607 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBP50607 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBP50607 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBP50607 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBP50607 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBP50607 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBP50607 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBP50607 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBP50607 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms