Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFSF10P50591 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF10P50591 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms