Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETV1P50549 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETV1P50549 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETV1P50549 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETV1P50549 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETV1P50549 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ETV1P50549 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETV1P50549 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ETV1P50549 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETV1P50549 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETV1P50549 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETV1P50549 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETV1P50549 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV1P50549 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV1P50549 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV1P50549 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV1P50549 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV1P50549 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV1P50549 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV1P50549 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV1P50549 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV1P50549 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV1P50549 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV1P50549 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV1P50549 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV1P50549 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV1P50549 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV1P50549 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV1P50549 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV1P50549 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV1P50549 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV1P50549 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV1P50549 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV1P50549 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV1P50549 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV1P50549 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV1P50549 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV1P50549 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV1P50549 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV1P50549 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV1P50549 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV1P50549 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV1P50549 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV1P50549 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV1P50549 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV1P50549 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV1P50549 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV1P50549 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV1P50549 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms