Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NUP153P49790 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NUP153P49790 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NUP153P49790 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NUP153P49790 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NUP153P49790 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NUP153P49790 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NUP153P49790 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
NUP153P49790 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NUP153P49790 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NUP153P49790 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NUP153P49790 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NUP153P49790 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NUP153P49790 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NUP153P49790 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NUP153P49790 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NUP153P49790 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NUP153P49790 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NUP153P49790 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
NUP153P49790 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP153P49790 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP153P49790 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP153P49790 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP153P49790 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP153P49790 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP153P49790 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP153P49790 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP153P49790 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP153P49790 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NUP153P49790 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NUP153P49790 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NUP153P49790 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
NUP153P49790 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NUP153P49790 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NUP153P49790 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NUP153P49790 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
NUP153P49790 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NUP153P49790 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NUP153P49790 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP153P49790 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP153P49790 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NUP153P49790 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NUP153P49790 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NUP153P49790 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
NUP153P49790 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NUP153P49790 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NUP153P49790 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NUP153P49790 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NUP153P49790 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NUP153P49790 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NUP153P49790 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NUP153P49790 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NUP153P49790 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NUP153P49790 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NUP153P49790 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NUP153P49790 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NUP153P49790 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NUP153P49790 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NUP153P49790 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NUP153P49790 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NUP153P49790 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
NUP153P49790 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NUP153P49790 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NUP153P49790 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NUP153P49790 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NUP153P49790 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NUP153P49790 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NUP153P49790 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NUP153P49790 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NUP153P49790 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NUP153P49790 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NUP153P49790 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NUP153P49790 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms