Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME1P48163 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME1P48163 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME1P48163 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME1P48163 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ME1P48163 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME1P48163 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME1P48163 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME1P48163 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME1P48163 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME1P48163 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME1P48163 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME1P48163 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME1P48163 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME1P48163 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ME1P48163 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME1P48163 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME1P48163 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME1P48163 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME1P48163 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME1P48163 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ME1P48163 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME1P48163 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME1P48163 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME1P48163 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME1P48163 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME1P48163 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME1P48163 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME1P48163 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME1P48163 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME1P48163 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME1P48163 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ME1P48163 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME1P48163 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME1P48163 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME1P48163 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ME1P48163 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME1P48163 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ME1P48163 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME1P48163 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME1P48163 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ME1P48163 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME1P48163 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME1P48163 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME1P48163 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME1P48163 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME1P48163 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME1P48163 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME1P48163 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME1P48163 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME1P48163 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME1P48163 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME1P48163 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME1P48163 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME1P48163 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME1P48163 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME1P48163 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME1P48163 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME1P48163 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ME1P48163 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME1P48163 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME1P48163 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME1P48163 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ME1P48163 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME1P48163 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME1P48163 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME1P48163 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME1P48163 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME1P48163 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME1P48163 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME1P48163 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME1P48163 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME1P48163 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME1P48163 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms