Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN1S1P47710 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN1S1P47710 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN1S1P47710 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN1S1P47710 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN1S1P47710 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN1S1P47710 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN1S1P47710 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN1S1P47710 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN1S1P47710 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN1S1P47710 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN1S1P47710 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms