Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV4P43268 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV4P43268 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV4P43268 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV4P43268 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV4P43268 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV4P43268 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ETV4P43268 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ETV4P43268 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ETV4P43268 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ETV4P43268 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV4P43268 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV4P43268 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV4P43268 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV4P43268 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV4P43268 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV4P43268 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV4P43268 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV4P43268 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV4P43268 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV4P43268 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV4P43268 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV4P43268 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV4P43268 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV4P43268 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV4P43268 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV4P43268 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV4P43268 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV4P43268 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV4P43268 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV4P43268 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV4P43268 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV4P43268 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV4P43268 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV4P43268 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV4P43268 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV4P43268 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV4P43268 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV4P43268 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV4P43268 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV4P43268 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV4P43268 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV4P43268 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV4P43268 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV4P43268 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV4P43268 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV4P43268 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV4P43268 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV4P43268 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV4P43268 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV4P43268 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV4P43268 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV4P43268 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms