Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER3P43115 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms