Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFSF9P41273 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms