Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4AP40617 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms