Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGP37231 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGP37231 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGP37231 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGP37231 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGP37231 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGP37231 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGP37231 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGP37231 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPARGP37231 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGP37231 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGP37231 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGP37231 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGP37231 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGP37231 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGP37231 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGP37231 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGP37231 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGP37231 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGP37231 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGP37231 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGP37231 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGP37231 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGP37231 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGP37231 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGP37231 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGP37231 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGP37231 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGP37231 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGP37231 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGP37231 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGP37231 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGP37231 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGP37231 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGP37231 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGP37231 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGP37231 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGP37231 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGP37231 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGP37231 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms