Protein–RNA interactions for Protein: P37058

HSD17B3, Testosterone 17-beta-dehydrogenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B3P37058 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSD17B3P37058 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSD17B3P37058 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSD17B3P37058 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms