Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACVR1BP36896 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms