Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXD13P35453 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD13P35453 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms