Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFN2P35080 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFN2P35080 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFN2P35080 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFN2P35080 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFN2P35080 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFN2P35080 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFN2P35080 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFN2P35080 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFN2P35080 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFN2P35080 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFN2P35080 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFN2P35080 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFN2P35080 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFN2P35080 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFN2P35080 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFN2P35080 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFN2P35080 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFN2P35080 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFN2P35080 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PFN2P35080 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFN2P35080 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFN2P35080 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFN2P35080 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFN2P35080 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFN2P35080 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFN2P35080 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFN2P35080 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFN2P35080 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFN2P35080 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFN2P35080 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFN2P35080 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFN2P35080 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFN2P35080 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFN2P35080 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PFN2P35080 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms