Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG3P32926 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG3P32926 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG3P32926 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG3P32926 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG3P32926 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG3P32926 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG3P32926 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG3P32926 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG3P32926 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG3P32926 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG3P32926 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG3P32926 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG3P32926 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG3P32926 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG3P32926 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG3P32926 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG3P32926 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG3P32926 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG3P32926 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG3P32926 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG3P32926 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG3P32926 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG3P32926 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG3P32926 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG3P32926 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG3P32926 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG3P32926 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG3P32926 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG3P32926 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG3P32926 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG3P32926 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG3P32926 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG3P32926 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DSG3P32926 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSG3P32926 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSG3P32926 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSG3P32926 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSG3P32926 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSG3P32926 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSG3P32926 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DSG3P32926 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG3P32926 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG3P32926 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG3P32926 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG3P32926 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG3P32926 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG3P32926 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG3P32926 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG3P32926 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG3P32926 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG3P32926 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG3P32926 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSG3P32926 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSG3P32926 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSG3P32926 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSG3P32926 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSG3P32926 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSG3P32926 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSG3P32926 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSG3P32926 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSG3P32926 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DSG3P32926 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSG3P32926 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSG3P32926 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG3P32926 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSG3P32926 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSG3P32926 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSG3P32926 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSG3P32926 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSG3P32926 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSG3P32926 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSG3P32926 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms