Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASQ1P31415 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASQ1P31415 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms