Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC13P31276 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC13P31276 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms