Protein–RNA interactions for Protein: P30533

LRPAP1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPAP1P30533 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRPAP1P30533 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRPAP1P30533 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPAP1P30533 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPAP1P30533 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPAP1P30533 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPAP1P30533 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPAP1P30533 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPAP1P30533 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPAP1P30533 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms