Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND2P30279 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND2P30279 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND2P30279 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND2P30279 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND2P30279 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND2P30279 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND2P30279 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND2P30279 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND2P30279 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND2P30279 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND2P30279 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND2P30279 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND2P30279 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND2P30279 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND2P30279 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND2P30279 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND2P30279 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND2P30279 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCND2P30279 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCND2P30279 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCND2P30279 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCND2P30279 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCND2P30279 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCND2P30279 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCND2P30279 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCND2P30279 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND2P30279 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND2P30279 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND2P30279 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND2P30279 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND2P30279 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND2P30279 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND2P30279 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND2P30279 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND2P30279 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND2P30279 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCND2P30279 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCND2P30279 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCND2P30279 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCND2P30279 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCND2P30279 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCND2P30279 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCND2P30279 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCND2P30279 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCND2P30279 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCND2P30279 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCND2P30279 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCND2P30279 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCND2P30279 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCND2P30279 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCND2P30279 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND2P30279 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND2P30279 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND2P30279 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND2P30279 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND2P30279 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND2P30279 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND2P30279 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND2P30279 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND2P30279 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND2P30279 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND2P30279 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND2P30279 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND2P30279 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND2P30279 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND2P30279 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND2P30279 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND2P30279 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND2P30279 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND2P30279 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND2P30279 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND2P30279 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND2P30279 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND2P30279 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND2P30279 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND2P30279 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND2P30279 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND2P30279 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND2P30279 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND2P30279 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND2P30279 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND2P30279 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCND2P30279 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCND2P30279 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCND2P30279 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCND2P30279 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCND2P30279 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCND2P30279 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCND2P30279 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCND2P30279 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCND2P30279 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCND2P30279 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCND2P30279 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCND2P30279 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND2P30279 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND2P30279 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND2P30279 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND2P30279 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND2P30279 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms