Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms