Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms