Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX3P26022 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX3P26022 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX3P26022 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX3P26022 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX3P26022 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX3P26022 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX3P26022 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX3P26022 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX3P26022 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX3P26022 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX3P26022 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX3P26022 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX3P26022 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX3P26022 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX3P26022 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX3P26022 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX3P26022 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX3P26022 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX3P26022 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX3P26022 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX3P26022 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX3P26022 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX3P26022 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX3P26022 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX3P26022 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX3P26022 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX3P26022 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX3P26022 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX3P26022 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX3P26022 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX3P26022 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX3P26022 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX3P26022 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX3P26022 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX3P26022 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX3P26022 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX3P26022 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX3P26022 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX3P26022 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX3P26022 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX3P26022 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX3P26022 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX3P26022 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX3P26022 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX3P26022 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX3P26022 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX3P26022 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX3P26022 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTX3P26022 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTX3P26022 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTX3P26022 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTX3P26022 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTX3P26022 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTX3P26022 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTX3P26022 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTX3P26022 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX3P26022 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX3P26022 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX3P26022 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX3P26022 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX3P26022 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX3P26022 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX3P26022 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX3P26022 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX3P26022 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX3P26022 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX3P26022 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX3P26022 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX3P26022 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX3P26022 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX3P26022 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX3P26022 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX3P26022 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX3P26022 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX3P26022 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX3P26022 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX3P26022 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX3P26022 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX3P26022 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX3P26022 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX3P26022 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX3P26022 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX3P26022 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX3P26022 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX3P26022 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX3P26022 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms