Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms