Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR2AP24928 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms