Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR1P24390 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms