Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1C1P21283 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1C1P21283 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP6V1C1P21283 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP6V1C1P21283 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1C1P21283 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1C1P21283 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1C1P21283 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1C1P21283 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1C1P21283 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1C1P21283 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1C1P21283 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1C1P21283 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms