Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASA1P20936 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASA1P20936 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASA1P20936 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA1P20936 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA1P20936 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA1P20936 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA1P20936 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA1P20936 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA1P20936 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA1P20936 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA1P20936 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA1P20936 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA1P20936 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA1P20936 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA1P20936 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA1P20936 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA1P20936 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA1P20936 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA1P20936 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA1P20936 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA1P20936 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA1P20936 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASA1P20936 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASA1P20936 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASA1P20936 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASA1P20936 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASA1P20936 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASA1P20936 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASA1P20936 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASA1P20936 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASA1P20936 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASA1P20936 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASA1P20936 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASA1P20936 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASA1P20936 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASA1P20936 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RASA1P20936 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RASA1P20936 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASA1P20936 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASA1P20936 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASA1P20936 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASA1P20936 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASA1P20936 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASA1P20936 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASA1P20936 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASA1P20936 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASA1P20936 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASA1P20936 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASA1P20936 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASA1P20936 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASA1P20936 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASA1P20936 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASA1P20936 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASA1P20936 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASA1P20936 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASA1P20936 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASA1P20936 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASA1P20936 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RASA1P20936 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASA1P20936 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASA1P20936 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASA1P20936 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASA1P20936 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA1P20936 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA1P20936 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA1P20936 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA1P20936 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA1P20936 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA1P20936 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASA1P20936 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASA1P20936 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASA1P20936 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASA1P20936 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RASA1P20936 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASA1P20936 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RASA1P20936 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASA1P20936 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASA1P20936 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASA1P20936 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASA1P20936 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RASA1P20936 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASA1P20936 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASA1P20936 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA1P20936 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA1P20936 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA1P20936 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA1P20936 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA1P20936 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA1P20936 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA1P20936 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RASA1P20936 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASA1P20936 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASA1P20936 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASA1P20936 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RASA1P20936 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASA1P20936 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASA1P20936 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASA1P20936 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASA1P20936 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms