Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL3P19876 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL3P19876 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL3P19876 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL3P19876 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL3P19876 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL3P19876 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL3P19876 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL3P19876 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL3P19876 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL3P19876 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL3P19876 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL3P19876 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms