Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM21P19474 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms