Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms