Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LBPP18428 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LBPP18428 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LBPP18428 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LBPP18428 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LBPP18428 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LBPP18428 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LBPP18428 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LBPP18428 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LBPP18428 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LBPP18428 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LBPP18428 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LBPP18428 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LBPP18428 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LBPP18428 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LBPP18428 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LBPP18428 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LBPP18428 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LBPP18428 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LBPP18428 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LBPP18428 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LBPP18428 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LBPP18428 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LBPP18428 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LBPP18428 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LBPP18428 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LBPP18428 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LBPP18428 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LBPP18428 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LBPP18428 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LBPP18428 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LBPP18428 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LBPP18428 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LBPP18428 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LBPP18428 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LBPP18428 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LBPP18428 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LBPP18428 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LBPP18428 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LBPP18428 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LBPP18428 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LBPP18428 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LBPP18428 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LBPP18428 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LBPP18428 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LBPP18428 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LBPP18428 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LBPP18428 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LBPP18428 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LBPP18428 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LBPP18428 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LBPP18428 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LBPP18428 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LBPP18428 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LBPP18428 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LBPP18428 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LBPP18428 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LBPP18428 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LBPP18428 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LBPP18428 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LBPP18428 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LBPP18428 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LBPP18428 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LBPP18428 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LBPP18428 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LBPP18428 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LBPP18428 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LBPP18428 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LBPP18428 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LBPP18428 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LBPP18428 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LBPP18428 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LBPP18428 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LBPP18428 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LBPP18428 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LBPP18428 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LBPP18428 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LBPP18428 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LBPP18428 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LBPP18428 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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