Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms