Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMD1P17707 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMD1P17707 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMD1P17707 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMD1P17707 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AMD1P17707 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMD1P17707 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMD1P17707 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMD1P17707 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMD1P17707 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMD1P17707 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMD1P17707 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMD1P17707 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMD1P17707 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMD1P17707 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMD1P17707 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMD1P17707 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMD1P17707 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMD1P17707 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMD1P17707 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMD1P17707 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMD1P17707 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMD1P17707 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMD1P17707 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMD1P17707 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMD1P17707 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AMD1P17707 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMD1P17707 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMD1P17707 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMD1P17707 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AMD1P17707 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMD1P17707 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMD1P17707 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMD1P17707 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMD1P17707 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMD1P17707 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMD1P17707 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMD1P17707 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMD1P17707 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMD1P17707 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMD1P17707 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMD1P17707 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMD1P17707 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMD1P17707 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMD1P17707 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMD1P17707 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMD1P17707 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMD1P17707 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMD1P17707 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMD1P17707 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMD1P17707 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMD1P17707 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMD1P17707 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMD1P17707 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMD1P17707 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMD1P17707 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMD1P17707 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AMD1P17707 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMD1P17707 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMD1P17707 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMD1P17707 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMD1P17707 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMD1P17707 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMD1P17707 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMD1P17707 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMD1P17707 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMD1P17707 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMD1P17707 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AMD1P17707 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMD1P17707 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms