Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTLA4P16410 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms