Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCK1P16333 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCK1P16333 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCK1P16333 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCK1P16333 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCK1P16333 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCK1P16333 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCK1P16333 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCK1P16333 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCK1P16333 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCK1P16333 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCK1P16333 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCK1P16333 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCK1P16333 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCK1P16333 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCK1P16333 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCK1P16333 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCK1P16333 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCK1P16333 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCK1P16333 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCK1P16333 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCK1P16333 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCK1P16333 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCK1P16333 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCK1P16333 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCK1P16333 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCK1P16333 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCK1P16333 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCK1P16333 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCK1P16333 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCK1P16333 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCK1P16333 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCK1P16333 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCK1P16333 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCK1P16333 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCK1P16333 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCK1P16333 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCK1P16333 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCK1P16333 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCK1P16333 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCK1P16333 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCK1P16333 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCK1P16333 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCK1P16333 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCK1P16333 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCK1P16333 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCK1P16333 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCK1P16333 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCK1P16333 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCK1P16333 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCK1P16333 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCK1P16333 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCK1P16333 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCK1P16333 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCK1P16333 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCK1P16333 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCK1P16333 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCK1P16333 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCK1P16333 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCK1P16333 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCK1P16333 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCK1P16333 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCK1P16333 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCK1P16333 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCK1P16333 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCK1P16333 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms