Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAG1P15918 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAG1P15918 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAG1P15918 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAG1P15918 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAG1P15918 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAG1P15918 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAG1P15918 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAG1P15918 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAG1P15918 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAG1P15918 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG1P15918 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG1P15918 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG1P15918 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG1P15918 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG1P15918 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG1P15918 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG1P15918 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG1P15918 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG1P15918 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAG1P15918 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAG1P15918 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAG1P15918 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAG1P15918 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAG1P15918 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAG1P15918 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAG1P15918 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAG1P15918 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAG1P15918 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAG1P15918 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAG1P15918 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAG1P15918 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAG1P15918 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAG1P15918 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAG1P15918 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAG1P15918 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAG1P15918 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAG1P15918 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAG1P15918 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAG1P15918 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAG1P15918 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAG1P15918 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAG1P15918 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAG1P15918 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAG1P15918 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAG1P15918 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAG1P15918 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAG1P15918 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAG1P15918 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAG1P15918 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAG1P15918 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAG1P15918 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAG1P15918 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAG1P15918 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAG1P15918 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAG1P15918 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAG1P15918 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAG1P15918 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAG1P15918 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAG1P15918 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAG1P15918 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAG1P15918 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAG1P15918 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAG1P15918 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAG1P15918 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAG1P15918 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAG1P15918 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAG1P15918 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAG1P15918 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAG1P15918 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAG1P15918 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAG1P15918 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAG1P15918 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAG1P15918 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAG1P15918 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAG1P15918 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAG1P15918 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAG1P15918 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAG1P15918 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAG1P15918 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAG1P15918 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAG1P15918 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAG1P15918 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAG1P15918 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms