Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2AP11388 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2AP11388 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOP2AP11388 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms