Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPB41P11171 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPB41P11171 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPB41P11171 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPB41P11171 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPB41P11171 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41P11171 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41P11171 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41P11171 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41P11171 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41P11171 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41P11171 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41P11171 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41P11171 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41P11171 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPB41P11171 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPB41P11171 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPB41P11171 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPB41P11171 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPB41P11171 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPB41P11171 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPB41P11171 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPB41P11171 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41P11171 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41P11171 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41P11171 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41P11171 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41P11171 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41P11171 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41P11171 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41P11171 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41P11171 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41P11171 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41P11171 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41P11171 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41P11171 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41P11171 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41P11171 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41P11171 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41P11171 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41P11171 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41P11171 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPB41P11171 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPB41P11171 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPB41P11171 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPB41P11171 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPB41P11171 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPB41P11171 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41P11171 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41P11171 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41P11171 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41P11171 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41P11171 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41P11171 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41P11171 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41P11171 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41P11171 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41P11171 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41P11171 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41P11171 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41P11171 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41P11171 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41P11171 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41P11171 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41P11171 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41P11171 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41P11171 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41P11171 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41P11171 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41P11171 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41P11171 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41P11171 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41P11171 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41P11171 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41P11171 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41P11171 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms