Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms